Además de la controversia que este espacio- que era una base militar- ha generado en la opinión pública y en el sector, desde su transformación en aeropuerto comercial la lluvia ha sido un problema en El Palomar. Según expertos su pista no es la mejor para operar en esas condiciones climáticas, obligando a reprogramar vuelos o derivarlos.
La filtración de agua a través de las luces del techo fue el primer indicio de que las instalaciones no resistirían una tormenta de esa magnitud. Personal del aeropuerto puso baldes para paliar la situación, pero nada pudieron hacer después cuando directamente cedió parte del techo.
El Aeropuerto El Palomar existe desde el año 1910 y desde 1968 se encuentra habilitado para el desarrollo de actividades aéreas de aviación general y comercial. En el año 2010, en ocasión de las reformas en el Aeroparque Jorge Newbery, los vuelos se trasladaron allí por más de 30 días.
Como reveló REPORTUR.com.ar, el gobierno nacional invirtió $ 209 millones para poner en valor la terminal existente, pese a las idas y vueltas y la confrontación que ha generado con sectores que se oponían a este nuevo destino para el predio, especialmente organismos de DDHH y vecinos del lugar (Convocan otra audiencia pública para ampliar el Aeropuerto del Palomar)